阿里云云数据库RDS MySQL的存储引擎包括：
- InnoDB：默认存储引擎，支持事务、行级锁、外键等特性，适合于数据写入和查询都比较频繁的场景。
- MyISAM：适合于读取频繁，写入不频繁的场景，不支持事务和行级锁，但是对于大量的查询效率较高，且支持全文索引。
- TokuDB：基于LSM树的高速存储引擎，适合于大数据量的OLTP和OLAP场景，支持高并发读写和高速数据插入，索引压缩，减小IO开销。
- Memory：内存引擎，数据存储在内存中，查询速度非常快，但是不支持持久化和大容量数据存储。
- X-Engine：阿里云自研的高速存储引擎，支持高效的旧数据回收和存放，适合于存储海量历史数据。
- PBXT：支持事务、行级锁、多版本控制，适合高并发的OLTP场景。
- RocksDB：适合于海量数据存储和高并发IO场景，支持全文索引和多版本控制。
阿里云云数据库RDS MySQL的存储引擎有以下几种选择：
- InnoDB：是MySQL5.5.8及以上版本默认的存储引擎，支持事务、锁定、外键等高级特性，可提供高并发、高可靠性、高可用性的数据库服务。
- MyISAM：不支持事务和行级锁定，但支持全文搜索和其他一些高级特性，适用于仅读取和写入不频繁的表。
- Memory：将数据存储在内存中，适用于读取和写入速度要求很高，但对数据持久性没有要求的场景。
- TokuDB：是一种高性能的存储引擎，具有高效的压缩、块级别的锁定、二级索引管理等特性，适用于超大数据、高并发、高可靠性的场景。
- X-DB：是一个可伸缩、高可用、高性能的分布式存储引擎，适用于海量数据、内存占用量较小、查询效率高的场景。
注：具体使用哪种存储引擎需要根据实际场景进行权衡和选择。
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